Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm9516-201ENSMUST00000119684 424 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms