Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cntn3Q07409 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cntn3Q07409 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cntn3Q07409 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cntn3Q07409 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cntn3Q07409 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cntn3Q07409 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Cntn3Q07409 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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