Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Prr13-202ENSMUST00000164688 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm2707-201ENSMUST00000188979 714 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Scgb2b1-201ENSMUST00000189372 338 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Pfn4-201ENSMUST00000020967 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Olfr700-202ENSMUST00000214840 1505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms