Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Nme7-201ENSMUST00000086028 834 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Olfr641-201ENSMUST00000098183 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm6348-201ENSMUST00000200751 1443 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm6468-201ENSMUST00000201076 1443 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm6346-201ENSMUST00000201146 1443 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 CT025548.2-201ENSMUST00000226227 1329 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm28274-202ENSMUST00000187775 1157 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm28202-203ENSMUST00000189780 1157 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Prr13-202ENSMUST00000164688 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms