Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms