Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ptprn2P80560 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ptprn2P80560 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ptprn2P80560 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ptprn2P80560 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ptprn2P80560 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptprn2P80560 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptprn2P80560 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptprn2P80560 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptprn2P80560 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptprn2P80560 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptprn2P80560 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptprn2P80560 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptprn2P80560 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptprn2P80560 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptprn2P80560 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptprn2P80560 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptprn2P80560 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptprn2P80560 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptprn2P80560 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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