Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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