Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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