Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Cd8a-201ENSMUST00000066747 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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