Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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NcanP55066 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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NcanP55066 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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NcanP55066 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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NcanP55066 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NcanP55066 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NcanP55066 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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