Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
FmodP50608 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms