Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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