Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd12P23812 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms