Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkcaP20444 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms