Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P20040 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P20040 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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P20040 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P20040 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P20040 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P20040 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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