Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Ccl20O89093 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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