Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm3239L7N2D9 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3239L7N2D9 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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