Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Gm20795J3QP49 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms