Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21977F6U3N7 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms