Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Myo5cE9Q1F5 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms