Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms