Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ckap5A2AGT5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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