Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms