Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vamp5Q9Z2P8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms