Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Crlf3Q9Z2L7 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Crlf3Q9Z2L7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Crlf3Q9Z2L7 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Crlf3Q9Z2L7 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Crlf3Q9Z2L7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Crlf3Q9Z2L7 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Crlf3Q9Z2L7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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