Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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