Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms