Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Swt1Q9DBQ9 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Swt1Q9DBQ9 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Swt1Q9DBQ9 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms