Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rexo2Q9D8S4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rexo2Q9D8S4 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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