Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc52a2Q9D8F3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms