Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc83Q9D4V3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms