Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Trappc6bQ9D289 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Trappc6bQ9D289 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Trappc6bQ9D289 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Trappc6bQ9D289 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
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