Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Krt88Q9CPR6 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Krt88Q9CPR6 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Krt88Q9CPR6 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Krt88Q9CPR6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Krt88Q9CPR6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Krt88Q9CPR6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Krt88Q9CPR6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Krt88Q9CPR6 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Krt88Q9CPR6 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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