Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim3Q99PE5 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms