Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms