Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm15351-202ENSMUST00000150686 271 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 AC160138.2-201ENSMUST00000220255 1531 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Stard3nl-205ENSMUST00000197565 1391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm17033-201ENSMUST00000146663 593 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 Gm37012-201ENSMUST00000194991 1078 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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