Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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TrabdQ99JY4 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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TrabdQ99JY4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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