Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Smim11aQ99J19 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Smim11aQ99J19 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Smim11aQ99J19 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim11aQ99J19 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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