Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms