Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIK8

Rfwd3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, mousemouse

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd3Q8CIK8 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rfwd3Q8CIK8 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms