Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm6129-201ENSMUST00000220725 801 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 4933439N14Rik-201ENSMUST00000211062 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd1bQ8CFT2 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms