Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Ercc8Q8CFD5 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Ercc8Q8CFD5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Ercc8Q8CFD5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
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Ercc8Q8CFD5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Ercc8Q8CFD5 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Ercc8Q8CFD5 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Ercc8Q8CFD5 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ercc8Q8CFD5 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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