Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cops7bQ8BV13 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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