Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 4930568E12Rik-202ENSMUST00000216694 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Spock3Q8BKV0 Olfr221-204ENSMUST00000216188 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms