Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Htatsf1Q8BGC0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Htatsf1Q8BGC0 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms