Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Amigo1Q80ZD8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Amigo1Q80ZD8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Amigo1Q80ZD8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Amigo1Q80ZD8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Amigo1Q80ZD8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Amigo1Q80ZD8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Amigo1Q80ZD8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms