Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NischQ80TM9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms