Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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