Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms