Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms